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Populus tremuloides gene model Potrs042046g26385.1
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Locus: Potrs042046g26385 
Transcript name:  Potrs042046g26385.1 
Chromosome: Potrs042046 
Start position:  6036 
End position:  8507 
Description:  threonine-protein kinase 
Best BLAST Aspen Potra001946g15392.1 Potri.019G086400.1  
Best BLAST ATG AT1G34300.1  
Other transcripts at this locus:  
Map Detail Image: 

 


Legend:      5'UTR          CDS          3'UTR               


Genomic Sequence (- strand)        upstream:    downstream:   
>Potrs042046:6036-8507[2472 nucleotides] 
ATGAAAACTCAAAATCTCCTCTTCTATCTGCTTCTCTTCTTCTGCACTACAGCAACATCACAAACAACGATCCAACCAGGCACCACTCTATCAGCTTCAAACCCAAACAAAACCTGGTCATCACCAAACAACACATTCTACATTGGATTTTCCCAAGTGAGCTTCTCTTCTTCTTACACCTTAACCATCAACTACAATGGTGGTGTCCCAATTTGGACAGCAGGCAATGCCACCACCACAGTTGACTCAAAGGGTTCCTTTCAGTTCCTGTCCTCCGGCAACCTCCTCCTCCTTAACGGCTCTGGCGCCATCGTTTGGGACTCTAACACTGATCGACTTGGTGTCACCACTGCTTCACTTGATGATTTTGGTAATTTAGTGTTAAAGAATGGAACTTTTTTTGTTTGGTCCTCATTTGATAACCCAACTGATACGATAGTGCCTAATCAAACTTTTACTGTGAATCAAGGTTTAAGATCTGGGTCTTATTCTTTTAGGTTTCTTAGTGCTGGAAATCTCACTTTGAGATGGAATGATAATATAGTATACTGGAATAAAGGGTTGAACTCTTCTGTTGATGCTAATTTGACTTCACCTGCTTTGGGGTTGCAACCAAATGGGATTTTGACAATTTTTGATGTTGCTTTTACAAGTGGGTCATATATTGTGGCATATAGTAATGATTATGCTGAAGGGAGCACGAGGTTGAGGTTTCTGAGGTTAGAAAAAGATGGGAACTTTAGGATGTATAGCACTGATATAGGTAGCGGAACTGCAACTATGGTATGGTCTGCTTTGACTGATCAATGTGAGATTTTTGGTTATTGTGGGAATATGGGGATTTGTAGTTATAATGAGTTGAGTTCGAGTTTGAGTCCGACTTGTGGTTGTCCATCTGAGAATTTTGAGCCTGTTGATGTGAATGATAGTAGACAAGGGTGTAAAAGAAAAGTTGAGATTGAGAGTTGTGTGGGGAGTGCTACCATGTTGGTGTTAGATAATGTGAAATTCTTGACGTATCTGCCTGAGACATCATCTCAGGTTTTCTTCGTGGGGATATCAGCTTGTAGGTTGAATTGTCTTTCTCAAAGTTCTTGTATTGCTTCAACATCTTTGTCGGATGGAACTGGCTCGTGTTACCTGAAAAATCAAGGTTTTATTAGTGGATATCAGAATCCAGCGCTTCCCAGTACTTCATATGTGAAAATTTGTGGGCCAGCACAACCAAACCCTCCACCTGGTGTGCAGATTGCAGGGAAGAGCAAAAGTTTGAGATTGCGTGTCTGGGTTGTTCTTGTTGTTGTTGTGATTACCCTTTTGGGTTTGATTGCTGTGGAGGGTGGTCTGTGGTGGTGGTGTTGTAGAAACAGTCCCAAGTTTGGCAGTTTGTCAGCTCAGTATGCACTACTGGAGTATGCATCCGGTGCTCCAGTGCAGTTCTCATATAAGGAGCTGCAGCATTCGACAAAAGAGTTTAAAGAGAAGCTTGGAGCAGGAGGGTTTGGAGCTGTTTACAAAGGGGTTCTAGATAATAGAACAGTTGTTGCAGTGAAGCAACTTGAGGGAATTGAACAGGGTGAGAAACAGTTCAGGATGGAGGTTGCAACTATTAGCAGCACCCACCATTTGAATTTGATCAGATTGATTGGTTTTTGCTCTGAGGGTCGTCATAGGCTGTTGGTTTATGATTTTATGAAAAACGGTTCTCTTGATAATTTCCTTTTCACTTCAGAAGAGCAGTCAGGTAGATTATTGAATTGGGAGCAGAGGTTTAACATTGCCCTTGGGACTGCAAGAGGAATCACATATCTTCATGAGGAATGTCGAGACTGCATTGTTCACTGTGACATCAAGCCAGAAAACATTCTCTTGGATGAGAACTACAATGCCAAGGTGTCTGACTTTGGTCTTGCAAAGCTTATAAATCCCGAGGATCACAGATATAGGACACTGGTCAGTGTTAGAGGGACAAGAGGATATTTGGCACCAGAGTGGATTGCAAATCTTCCAATAACTTCCAAATCTGATATCTACAGTTATGGGATGGTTTTGTTGGAGATAGTGAGTGGCAGAAGGAACTATGAAGTCTCATCGGAGACAAACCGTAAAAAGTTCTCTGTCTGGGCCTGCGAAGAGTTTGAGAAGGGTGATGTTAATGCGATTTTGGACCAAAGGCTTACAGACCAAGATTTGGATCTGGATCAAGTGACAAGGGCTATTCAAGTGAGCTTTTGGTGCATCCAGGAGCAACCATCTCAAAGGCCAACGATGGGGAAAGTGGTGCAGATGCTGGAAGGAATTTCTGAGATTGAGAGACCACCAGCTCCAAAGACAATAACAGAAGGTTCTTTTGGTGGAAGTAATGTAAGTGTGAGTAGCAATGTCAGTGCTCTCTCGACTTTTGAGGTTTTAGCACCCGCTCTCTCATCTTCCTCATCATATCAGACTATAGGAATTTCACCTTTAGCTTAA
   


CDS sequence:
>Potrs042046g26385.1[2472 nucleotides] 
ATGAAAACTCAAAATCTCCTCTTCTATCTGCTTCTCTTCTTCTGCACTACAGCAACATCACAAACAACGATCCAACCAGGCACCACTCTATCAGCTTCAAACCCAAACAAAACCTGGTCATCACCAAACAACACATTCTACATTGGATTTTCCCAAGTGAGCTTCTCTTCTTCTTACACCTTAACCATCAACTACAATGGTGGTGTCCCAATTTGGACAGCAGGCAATGCCACCACCACAGTTGACTCAAAGGGTTCCTTTCAGTTCCTGTCCTCCGGCAACCTCCTCCTCCTTAACGGCTCTGGCGCCATCGTTTGGGACTCTAACACTGATCGACTTGGTGTCACCACTGCTTCACTTGATGATTTTGGTAATTTAGTGTTAAAGAATGGAACTTTTTTTGTTTGGTCCTCATTTGATAACCCAACTGATACGATAGTGCCTAATCAAACTTTTACTGTGAATCAAGGTTTAAGATCTGGGTCTTATTCTTTTAGGTTTCTTAGTGCTGGAAATCTCACTTTGAGATGGAATGATAATATAGTATACTGGAATAAAGGGTTGAACTCTTCTGTTGATGCTAATTTGACTTCACCTGCTTTGGGGTTGCAACCAAATGGGATTTTGACAATTTTTGATGTTGCTTTTACAAGTGGGTCATATATTGTGGCATATAGTAATGATTATGCTGAAGGGAGCACGAGGTTGAGGTTTCTGAGGTTAGAAAAAGATGGGAACTTTAGGATGTATAGCACTGATATAGGTAGCGGAACTGCAACTATGGTATGGTCTGCTTTGACTGATCAATGTGAGATTTTTGGTTATTGTGGGAATATGGGGATTTGTAGTTATAATGAGTTGAGTTCGAGTTTGAGTCCGACTTGTGGTTGTCCATCTGAGAATTTTGAGCCTGTTGATGTGAATGATAGTAGACAAGGGTGTAAAAGAAAAGTTGAGATTGAGAGTTGTGTGGGGAGTGCTACCATGTTGGTGTTAGATAATGTGAAATTCTTGACGTATCTGCCTGAGACATCATCTCAGGTTTTCTTCGTGGGGATATCAGCTTGTAGGTTGAATTGTCTTTCTCAAAGTTCTTGTATTGCTTCAACATCTTTGTCGGATGGAACTGGCTCGTGTTACCTGAAAAATCAAGGTTTTATTAGTGGATATCAGAATCCAGCGCTTCCCAGTACTTCATATGTGAAAATTTGTGGGCCAGCACAACCAAACCCTCCACCTGGTGTGCAGATTGCAGGGAAGAGCAAAAGTTTGAGATTGCGTGTCTGGGTTGTTCTTGTTGTTGTTGTGATTACCCTTTTGGGTTTGATTGCTGTGGAGGGTGGTCTGTGGTGGTGGTGTTGTAGAAACAGTCCCAAGTTTGGCAGTTTGTCAGCTCAGTATGCACTACTGGAGTATGCATCCGGTGCTCCAGTGCAGTTCTCATATAAGGAGCTGCAGCATTCGACAAAAGAGTTTAAAGAGAAGCTTGGAGCAGGAGGGTTTGGAGCTGTTTACAAAGGGGTTCTAGATAATAGAACAGTTGTTGCAGTGAAGCAACTTGAGGGAATTGAACAGGGTGAGAAACAGTTCAGGATGGAGGTTGCAACTATTAGCAGCACCCACCATTTGAATTTGATCAGATTGATTGGTTTTTGCTCTGAGGGTCGTCATAGGCTGTTGGTTTATGATTTTATGAAAAACGGTTCTCTTGATAATTTCCTTTTCACTTCAGAAGAGCAGTCAGGTAGATTATTGAATTGGGAGCAGAGGTTTAACATTGCCCTTGGGACTGCAAGAGGAATCACATATCTTCATGAGGAATGTCGAGACTGCATTGTTCACTGTGACATCAAGCCAGAAAACATTCTCTTGGATGAGAACTACAATGCCAAGGTGTCTGACTTTGGTCTTGCAAAGCTTATAAATCCCGAGGATCACAGATATAGGACACTGGTCAGTGTTAGAGGGACAAGAGGATATTTGGCACCAGAGTGGATTGCAAATCTTCCAATAACTTCCAAATCTGATATCTACAGTTATGGGATGGTTTTGTTGGAGATAGTGAGTGGCAGAAGGAACTATGAAGTCTCATCGGAGACAAACCGTAAAAAGTTCTCTGTCTGGGCCTGCGAAGAGTTTGAGAAGGGTGATGTTAATGCGATTTTGGACCAAAGGCTTACAGACCAAGATTTGGATCTGGATCAAGTGACAAGGGCTATTCAAGTGAGCTTTTGGTGCATCCAGGAGCAACCATCTCAAAGGCCAACGATGGGGAAAGTGGTGCAGATGCTGGAAGGAATTTCTGAGATTGAGAGACCACCAGCTCCAAAGACAATAACAGAAGGTTCTTTTGGTGGAAGTAATGTAAGTGTGAGTAGCAATGTCAGTGCTCTCTCGACTTTTGAGGTTTTAGCACCCGCTCTCTCATCTTCCTCATCATATCAGACTATAGGAATTTCACCTTTAGCTTAA
   

Transcript sequence:
>Potrs042046g26385.1[2472 nucleotides] 
ATGAAAACTCAAAATCTCCTCTTCTATCTGCTTCTCTTCTTCTGCACTACAGCAACATCACAAACAACGATCCAACCAGGCACCACTCTATCAGCTTCAAACCCAAACAAAACCTGGTCATCACCAAACAACACATTCTACATTGGATTTTCCCAAGTGAGCTTCTCTTCTTCTTACACCTTAACCATCAACTACAATGGTGGTGTCCCAATTTGGACAGCAGGCAATGCCACCACCACAGTTGACTCAAAGGGTTCCTTTCAGTTCCTGTCCTCCGGCAACCTCCTCCTCCTTAACGGCTCTGGCGCCATCGTTTGGGACTCTAACACTGATCGACTTGGTGTCACCACTGCTTCACTTGATGATTTTGGTAATTTAGTGTTAAAGAATGGAACTTTTTTTGTTTGGTCCTCATTTGATAACCCAACTGATACGATAGTGCCTAATCAAACTTTTACTGTGAATCAAGGTTTAAGATCTGGGTCTTATTCTTTTAGGTTTCTTAGTGCTGGAAATCTCACTTTGAGATGGAATGATAATATAGTATACTGGAATAAAGGGTTGAACTCTTCTGTTGATGCTAATTTGACTTCACCTGCTTTGGGGTTGCAACCAAATGGGATTTTGACAATTTTTGATGTTGCTTTTACAAGTGGGTCATATATTGTGGCATATAGTAATGATTATGCTGAAGGGAGCACGAGGTTGAGGTTTCTGAGGTTAGAAAAAGATGGGAACTTTAGGATGTATAGCACTGATATAGGTAGCGGAACTGCAACTATGGTATGGTCTGCTTTGACTGATCAATGTGAGATTTTTGGTTATTGTGGGAATATGGGGATTTGTAGTTATAATGAGTTGAGTTCGAGTTTGAGTCCGACTTGTGGTTGTCCATCTGAGAATTTTGAGCCTGTTGATGTGAATGATAGTAGACAAGGGTGTAAAAGAAAAGTTGAGATTGAGAGTTGTGTGGGGAGTGCTACCATGTTGGTGTTAGATAATGTGAAATTCTTGACGTATCTGCCTGAGACATCATCTCAGGTTTTCTTCGTGGGGATATCAGCTTGTAGGTTGAATTGTCTTTCTCAAAGTTCTTGTATTGCTTCAACATCTTTGTCGGATGGAACTGGCTCGTGTTACCTGAAAAATCAAGGTTTTATTAGTGGATATCAGAATCCAGCGCTTCCCAGTACTTCATATGTGAAAATTTGTGGGCCAGCACAACCAAACCCTCCACCTGGTGTGCAGATTGCAGGGAAGAGCAAAAGTTTGAGATTGCGTGTCTGGGTTGTTCTTGTTGTTGTTGTGATTACCCTTTTGGGTTTGATTGCTGTGGAGGGTGGTCTGTGGTGGTGGTGTTGTAGAAACAGTCCCAAGTTTGGCAGTTTGTCAGCTCAGTATGCACTACTGGAGTATGCATCCGGTGCTCCAGTGCAGTTCTCATATAAGGAGCTGCAGCATTCGACAAAAGAGTTTAAAGAGAAGCTTGGAGCAGGAGGGTTTGGAGCTGTTTACAAAGGGGTTCTAGATAATAGAACAGTTGTTGCAGTGAAGCAACTTGAGGGAATTGAACAGGGTGAGAAACAGTTCAGGATGGAGGTTGCAACTATTAGCAGCACCCACCATTTGAATTTGATCAGATTGATTGGTTTTTGCTCTGAGGGTCGTCATAGGCTGTTGGTTTATGATTTTATGAAAAACGGTTCTCTTGATAATTTCCTTTTCACTTCAGAAGAGCAGTCAGGTAGATTATTGAATTGGGAGCAGAGGTTTAACATTGCCCTTGGGACTGCAAGAGGAATCACATATCTTCATGAGGAATGTCGAGACTGCATTGTTCACTGTGACATCAAGCCAGAAAACATTCTCTTGGATGAGAACTACAATGCCAAGGTGTCTGACTTTGGTCTTGCAAAGCTTATAAATCCCGAGGATCACAGATATAGGACACTGGTCAGTGTTAGAGGGACAAGAGGATATTTGGCACCAGAGTGGATTGCAAATCTTCCAATAACTTCCAAATCTGATATCTACAGTTATGGGATGGTTTTGTTGGAGATAGTGAGTGGCAGAAGGAACTATGAAGTCTCATCGGAGACAAACCGTAAAAAGTTCTCTGTCTGGGCCTGCGAAGAGTTTGAGAAGGGTGATGTTAATGCGATTTTGGACCAAAGGCTTACAGACCAAGATTTGGATCTGGATCAAGTGACAAGGGCTATTCAAGTGAGCTTTTGGTGCATCCAGGAGCAACCATCTCAAAGGCCAACGATGGGGAAAGTGGTGCAGATGCTGGAAGGAATTTCTGAGATTGAGAGACCACCAGCTCCAAAGACAATAACAGAAGGTTCTTTTGGTGGAAGTAATGTAAGTGTGAGTAGCAATGTCAGTGCTCTCTCGACTTTTGAGGTTTTAGCACCCGCTCTCTCATCTTCCTCATCATATCAGACTATAGGAATTTCACCTTTAGCTTAA
   

Protein sequence:
>Potrs042046g26385.1[823 residues] 
MKTQNLLFYLLLFFCTTATSQTTIQPGTTLSASNPNKTWSSPNNTFYIGFSQVSFSSSYTLTINYNGGVPIWTAGNATTTVDSKGSFQFLSSGNLLLLNGSGAIVWDSNTDRLGVTTASLDDFGNLVLKNGTFFVWSSFDNPTDTIVPNQTFTVNQGLRSGSYSFRFLSAGNLTLRWNDNIVYWNKGLNSSVDANLTSPALGLQPNGILTIFDVAFTSGSYIVAYSNDYAEGSTRLRFLRLEKDGNFRMYSTDIGSGTATMVWSALTDQCEIFGYCGNMGICSYNELSSSLSPTCGCPSENFEPVDVNDSRQGCKRKVEIESCVGSATMLVLDNVKFLTYLPETSSQVFFVGISACRLNCLSQSSCIASTSLSDGTGSCYLKNQGFISGYQNPALPSTSYVKICGPAQPNPPPGVQIAGKSKSLRLRVWVVLVVVVITLLGLIAVEGGLWWWCCRNSPKFGSLSAQYALLEYASGAPVQFSYKELQHSTKEFKEKLGAGGFGAVYKGVLDNRTVVAVKQLEGIEQGEKQFRMEVATISSTHHLNLIRLIGFCSEGRHRLLVYDFMKNGSLDNFLFTSEEQSGRLLNWEQRFNIALGTARGITYLHEECRDCIVHCDIKPENILLDENYNAKVSDFGLAKLINPEDHRYRTLVSVRGTRGYLAPEWIANLPITSKSDIYSYGMVLLEIVSGRRNYEVSSETNRKKFSVWACEEFEKGDVNAILDQRLTDQDLDLDQVTRAIQVSFWCIQEQPSQRPTMGKVVQMLEGISEIERPPAPKTITEGSFGGSNVSVSSNVSALSTFEVLAPALSSSSSYQTIGISPLA
   



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