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Populus trichocarpa gene Potri.019G086200
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Locus: Potri.019G086200 
Transcript name:  Potri.019G086200.1 
Protein name:  27025350_peptide 
PAC Transcript ID : 27025350 
Chromosome: Chr19 
Start position:  11841026 
End position:  11843838 
Synonyms:  eugene3.00190782;POPTR_0019s11610; 
Description:   
Best BLAST Aspen Potra000982g08122.1 Potrs003547g05365.1  
Best BLAST ATG  
Other transcripts at this locus:  
Map Detail Image: 

 


Legend:      5'UTR          CDS          3'UTR               


Genomic Sequence (- strand)        upstream:    downstream:   
>Chr19:11841026-11843838[2813 nucleotides] 
ATGAAACCTCAAAATCTTCTCTTTTCCCTGTTTCTCTTCTTCACTGTCACAACAGCACAACCAACAATCCAACCAGGCACCACCCTTTCAGCTGCAAACCCAGGCCAAACATGGTCGTCACCGAACAACACTTTCTACGTAGGATTTTCCCAAGTGGACTCCTCTTCTTATTACACCTTAACCATCAACTACAACGGTGGTGTCCCAATTTGGACAGCAGGTAATGCTACCACCACAGTTGACTCAAAGGGGTCCTTTCAATTCCTGCCATCTGGCAACCTCCGCCTCCTCAACGGGTCTGGCGCCGTTGTTTGGGATTCTAACACTGCTAGACTTGGTGTCACCACTGCTTCCCTTGATGATTTTGGTAATTTAGTGTTAAAGAATGGAACATCAACTGTTTGGTCTTCATTTGATAACCCAACTGATACGATAGTACCTAATCAGAATTTTAGTGTGAATCAAGTTTTAAGATCTGAGTCTTATCATTTTAGGTTTCTTAGTAACGGAAATCTCACTTTGAGATGGAATGATTTTATATTGTATTGGAATCAAGGGTTGAACTCTTCTCTTGATGTTAATTTGACTTCACCTACTTTGGGGTTGCAACGAACGGGGGTTTTGACAATTTTTGATGTTGCTTTTCCAAGTGGGTCGTATACTGTGGCATCTAGTAATGATTATGATGAAGGGGGCACAAGGTTGAGGTTTTTGAGGTTAGGAAAAGATGGGAACTTTAGGATGTATAGCACTGCTATAGGTACCGGAACTATAACTATGGTATGGTCTGCTTTGACTGATCAATGTGAGGTTTTTGGTTATTGTGGGAATATGGGGATTTGTAGGTATAACGAGTCGAGTTCGAGTCCGAATTGTGGCTGTCCATCTGAGAATTTTGAGCCTGTTGATGTGAATGACAGTAGACAAGGGTGTAAAAGAAAAGTTGAGATTGAGAGTTGCGTGGGGAATGCTACTATGTTGGTGTTAGATAATGCGAAATTCTTGACATATCAGCCTGAGACATTATCTCAGGTTTTCTCTAATGGGATATCAGCTTGTAGGCTGAATTGTCTTTCTCAAAGTTCTTGTATTGCTTCGACGTCTTTGTCAGATGGAACTGGCATGTGTTACCTGAAAAATTCAGATTTTATTAGTGGATATCAGAATCCAGTGCTTCCCAGCACTTCTTATGTGAAAGTTTGTGGGCAAGCACAACCAAACCCTCCACCTGGTTTGCAGATTGCGGAGAAGAGCAAAAGTTCAAGCTTGCGTGTCTGGGTTGTTCTTGTTGTTGTTGTGATTACCCTTTTGGGTTTGATTGCTGTGGAGGGTGGTCTGTGGTGGTGGTGTTGTAGAAACAGTCCCAAGTTTGGCAGTTTGTCAGCTCAGTATGCCCTACTGGAGTATGCATCCGGTGCTCCAGTGCAGTTCTCATATAAGGAGCTGCAGCGTTCGACAAAACAGTTTAAAGAGAAGCTTGGAGCAGGAGGGTTTGGAGCTGTTTACAAAGGGGTTCTAGCTAATAGGACAGTTGTTGCAGTGAAGCAACTTGAGGGAATTGAACAGGGTGAGAAACAGTTCAGGATGGAGGTTGCAACTATTAGCAGCACTCACCATTTGAATTTGGTCAGATTGATTGGTTTTTGCTCTGAGGGTCGTCATAGGCTTCTGGTTTACGAGTTCATGAAAAATGGGTCTCTTGATAATTTCCTTTTCACTACAGAAGAGCAGCCAGGAAGATTGTTGAATTGGGAGCAGAGGTTTAACATTGCCCTTGGAACTGCAAGAGGAATCACATATCTTCACGAGGAATGTCGAGACTGCATTGTCCACTGTGACATAAAGCCAGAAAACATTCTCTTGGATGAGAACTACAATGCCAAGGTTTCTGATTTTGGTCTTGCAAAGCTCATAAGTCCCAGGGATCACAGATATAGGACACTAACAAGTGTTAGAGGGACAAGAGGATACTTGGCACCTGAGTGGCTTGCAAACCTTCCAATCACCTCCAAATCTGATATCTACGGTTACGGGATGGTTTTGTTGGAGATAGTGAGTGGCAGAAGGAATTTTGAGGTCTCAGCAGAAACCGACCGAAAAAAGTTCTCTGCCTGGGCTTATGAAGAGTTTGAGAAGAGTAATGTAACTGCAATTTTGGACCAAAGGCTTACAGACCAAGATGTGGATATGCAGCAAGTGACAAGGGCAATTCAAGTGAGCTTTTGGTGCATCCAGGACCAACCATCTCAGAGGCCTAAGATGGGAAAAGTGGTGCAGATGCTGGAGGGAATTTCTGAGATTGAGAACCCACCGGCACCAAAGGCTATAACAGAAGGTTCTATTCCTGGAACCAGCATATTGAGCAGCAGCAATGTGAGTGCTCTATCAACTTTTGCACCTTCAGCTCCCACTCCCTCATCTTCCTCATCATACCAGACTCTAGGAGTTTCACCATTAGCTTCTGGGAGAAATATCGAGAGGGCATCTTCGTCGCTGCTGCCTTGATCAGACCCAAACTGAAGCCAATCATCATACATGCCATTTGCCTGCAATACCGAGGAACTCGAAGGAAGTAACCATTTGTGATGAGATACTACATTATATTGACATGACAACAAAATAATGTTGAAATTATTTCCAACTATATTGCTATACATTAGATGTTTCCCATTCAATGATTGAAAATAGATATCAGACACAAATGATGTACAGGGATTTGCTAGTTTTATAATGTCCCAAGACTTGTTGTGGATACTAAAAAATCCATGCACGCCAAGTTATTCTTATAATAACTAATTTAATGCATTGTTCTG
   

CDS sequence:
>Potri.019G086200.1[2505 nucleotides] 
ATGAAACCTCAAAATCTTCTCTTTTCCCTGTTTCTCTTCTTCACTGTCACAACAGCACAACCAACAATCCAACCAGGCACCACCCTTTCAGCTGCAAACCCAGGCCAAACATGGTCGTCACCGAACAACACTTTCTACGTAGGATTTTCCCAAGTGGACTCCTCTTCTTATTACACCTTAACCATCAACTACAACGGTGGTGTCCCAATTTGGACAGCAGGTAATGCTACCACCACAGTTGACTCAAAGGGGTCCTTTCAATTCCTGCCATCTGGCAACCTCCGCCTCCTCAACGGGTCTGGCGCCGTTGTTTGGGATTCTAACACTGCTAGACTTGGTGTCACCACTGCTTCCCTTGATGATTTTGGTAATTTAGTGTTAAAGAATGGAACATCAACTGTTTGGTCTTCATTTGATAACCCAACTGATACGATAGTACCTAATCAGAATTTTAGTGTGAATCAAGTTTTAAGATCTGAGTCTTATCATTTTAGGTTTCTTAGTAACGGAAATCTCACTTTGAGATGGAATGATTTTATATTGTATTGGAATCAAGGGTTGAACTCTTCTCTTGATGTTAATTTGACTTCACCTACTTTGGGGTTGCAACGAACGGGGGTTTTGACAATTTTTGATGTTGCTTTTCCAAGTGGGTCGTATACTGTGGCATCTAGTAATGATTATGATGAAGGGGGCACAAGGTTGAGGTTTTTGAGGTTAGGAAAAGATGGGAACTTTAGGATGTATAGCACTGCTATAGGTACCGGAACTATAACTATGGTATGGTCTGCTTTGACTGATCAATGTGAGGTTTTTGGTTATTGTGGGAATATGGGGATTTGTAGGTATAACGAGTCGAGTTCGAGTCCGAATTGTGGCTGTCCATCTGAGAATTTTGAGCCTGTTGATGTGAATGACAGTAGACAAGGGTGTAAAAGAAAAGTTGAGATTGAGAGTTGCGTGGGGAATGCTACTATGTTGGTGTTAGATAATGCGAAATTCTTGACATATCAGCCTGAGACATTATCTCAGGTTTTCTCTAATGGGATATCAGCTTGTAGGCTGAATTGTCTTTCTCAAAGTTCTTGTATTGCTTCGACGTCTTTGTCAGATGGAACTGGCATGTGTTACCTGAAAAATTCAGATTTTATTAGTGGATATCAGAATCCAGTGCTTCCCAGCACTTCTTATGTGAAAGTTTGTGGGCAAGCACAACCAAACCCTCCACCTGGTTTGCAGATTGCGGAGAAGAGCAAAAGTTCAAGCTTGCGTGTCTGGGTTGTTCTTGTTGTTGTTGTGATTACCCTTTTGGGTTTGATTGCTGTGGAGGGTGGTCTGTGGTGGTGGTGTTGTAGAAACAGTCCCAAGTTTGGCAGTTTGTCAGCTCAGTATGCCCTACTGGAGTATGCATCCGGTGCTCCAGTGCAGTTCTCATATAAGGAGCTGCAGCGTTCGACAAAACAGTTTAAAGAGAAGCTTGGAGCAGGAGGGTTTGGAGCTGTTTACAAAGGGGTTCTAGCTAATAGGACAGTTGTTGCAGTGAAGCAACTTGAGGGAATTGAACAGGGTGAGAAACAGTTCAGGATGGAGGTTGCAACTATTAGCAGCACTCACCATTTGAATTTGGTCAGATTGATTGGTTTTTGCTCTGAGGGTCGTCATAGGCTTCTGGTTTACGAGTTCATGAAAAATGGGTCTCTTGATAATTTCCTTTTCACTACAGAAGAGCAGCCAGGAAGATTGTTGAATTGGGAGCAGAGGTTTAACATTGCCCTTGGAACTGCAAGAGGAATCACATATCTTCACGAGGAATGTCGAGACTGCATTGTCCACTGTGACATAAAGCCAGAAAACATTCTCTTGGATGAGAACTACAATGCCAAGGTTTCTGATTTTGGTCTTGCAAAGCTCATAAGTCCCAGGGATCACAGATATAGGACACTAACAAGTGTTAGAGGGACAAGAGGATACTTGGCACCTGAGTGGCTTGCAAACCTTCCAATCACCTCCAAATCTGATATCTACGGTTACGGGATGGTTTTGTTGGAGATAGTGAGTGGCAGAAGGAATTTTGAGGTCTCAGCAGAAACCGACCGAAAAAAGTTCTCTGCCTGGGCTTATGAAGAGTTTGAGAAGAGTAATGTAACTGCAATTTTGGACCAAAGGCTTACAGACCAAGATGTGGATATGCAGCAAGTGACAAGGGCAATTCAAGTGAGCTTTTGGTGCATCCAGGACCAACCATCTCAGAGGCCTAAGATGGGAAAAGTGGTGCAGATGCTGGAGGGAATTTCTGAGATTGAGAACCCACCGGCACCAAAGGCTATAACAGAAGGTTCTATTCCTGGAACCAGCATATTGAGCAGCAGCAATGTGAGTGCTCTATCAACTTTTGCACCTTCAGCTCCCACTCCCTCATCTTCCTCATCATACCAGACTCTAGGAGTTTCACCATTAGCTTCTGGGAGAAATATCGAGAGGGCATCTTCGTCGCTGCTGCCTTGA
   

Transcript sequence:
>Potri.019G086200.1[2813 nucleotides] 
ATGAAACCTCAAAATCTTCTCTTTTCCCTGTTTCTCTTCTTCACTGTCACAACAGCACAACCAACAATCCAACCAGGCACCACCCTTTCAGCTGCAAACCCAGGCCAAACATGGTCGTCACCGAACAACACTTTCTACGTAGGATTTTCCCAAGTGGACTCCTCTTCTTATTACACCTTAACCATCAACTACAACGGTGGTGTCCCAATTTGGACAGCAGGTAATGCTACCACCACAGTTGACTCAAAGGGGTCCTTTCAATTCCTGCCATCTGGCAACCTCCGCCTCCTCAACGGGTCTGGCGCCGTTGTTTGGGATTCTAACACTGCTAGACTTGGTGTCACCACTGCTTCCCTTGATGATTTTGGTAATTTAGTGTTAAAGAATGGAACATCAACTGTTTGGTCTTCATTTGATAACCCAACTGATACGATAGTACCTAATCAGAATTTTAGTGTGAATCAAGTTTTAAGATCTGAGTCTTATCATTTTAGGTTTCTTAGTAACGGAAATCTCACTTTGAGATGGAATGATTTTATATTGTATTGGAATCAAGGGTTGAACTCTTCTCTTGATGTTAATTTGACTTCACCTACTTTGGGGTTGCAACGAACGGGGGTTTTGACAATTTTTGATGTTGCTTTTCCAAGTGGGTCGTATACTGTGGCATCTAGTAATGATTATGATGAAGGGGGCACAAGGTTGAGGTTTTTGAGGTTAGGAAAAGATGGGAACTTTAGGATGTATAGCACTGCTATAGGTACCGGAACTATAACTATGGTATGGTCTGCTTTGACTGATCAATGTGAGGTTTTTGGTTATTGTGGGAATATGGGGATTTGTAGGTATAACGAGTCGAGTTCGAGTCCGAATTGTGGCTGTCCATCTGAGAATTTTGAGCCTGTTGATGTGAATGACAGTAGACAAGGGTGTAAAAGAAAAGTTGAGATTGAGAGTTGCGTGGGGAATGCTACTATGTTGGTGTTAGATAATGCGAAATTCTTGACATATCAGCCTGAGACATTATCTCAGGTTTTCTCTAATGGGATATCAGCTTGTAGGCTGAATTGTCTTTCTCAAAGTTCTTGTATTGCTTCGACGTCTTTGTCAGATGGAACTGGCATGTGTTACCTGAAAAATTCAGATTTTATTAGTGGATATCAGAATCCAGTGCTTCCCAGCACTTCTTATGTGAAAGTTTGTGGGCAAGCACAACCAAACCCTCCACCTGGTTTGCAGATTGCGGAGAAGAGCAAAAGTTCAAGCTTGCGTGTCTGGGTTGTTCTTGTTGTTGTTGTGATTACCCTTTTGGGTTTGATTGCTGTGGAGGGTGGTCTGTGGTGGTGGTGTTGTAGAAACAGTCCCAAGTTTGGCAGTTTGTCAGCTCAGTATGCCCTACTGGAGTATGCATCCGGTGCTCCAGTGCAGTTCTCATATAAGGAGCTGCAGCGTTCGACAAAACAGTTTAAAGAGAAGCTTGGAGCAGGAGGGTTTGGAGCTGTTTACAAAGGGGTTCTAGCTAATAGGACAGTTGTTGCAGTGAAGCAACTTGAGGGAATTGAACAGGGTGAGAAACAGTTCAGGATGGAGGTTGCAACTATTAGCAGCACTCACCATTTGAATTTGGTCAGATTGATTGGTTTTTGCTCTGAGGGTCGTCATAGGCTTCTGGTTTACGAGTTCATGAAAAATGGGTCTCTTGATAATTTCCTTTTCACTACAGAAGAGCAGCCAGGAAGATTGTTGAATTGGGAGCAGAGGTTTAACATTGCCCTTGGAACTGCAAGAGGAATCACATATCTTCACGAGGAATGTCGAGACTGCATTGTCCACTGTGACATAAAGCCAGAAAACATTCTCTTGGATGAGAACTACAATGCCAAGGTTTCTGATTTTGGTCTTGCAAAGCTCATAAGTCCCAGGGATCACAGATATAGGACACTAACAAGTGTTAGAGGGACAAGAGGATACTTGGCACCTGAGTGGCTTGCAAACCTTCCAATCACCTCCAAATCTGATATCTACGGTTACGGGATGGTTTTGTTGGAGATAGTGAGTGGCAGAAGGAATTTTGAGGTCTCAGCAGAAACCGACCGAAAAAAGTTCTCTGCCTGGGCTTATGAAGAGTTTGAGAAGAGTAATGTAACTGCAATTTTGGACCAAAGGCTTACAGACCAAGATGTGGATATGCAGCAAGTGACAAGGGCAATTCAAGTGAGCTTTTGGTGCATCCAGGACCAACCATCTCAGAGGCCTAAGATGGGAAAAGTGGTGCAGATGCTGGAGGGAATTTCTGAGATTGAGAACCCACCGGCACCAAAGGCTATAACAGAAGGTTCTATTCCTGGAACCAGCATATTGAGCAGCAGCAATGTGAGTGCTCTATCAACTTTTGCACCTTCAGCTCCCACTCCCTCATCTTCCTCATCATACCAGACTCTAGGAGTTTCACCATTAGCTTCTGGGAGAAATATCGAGAGGGCATCTTCGTCGCTGCTGCCTTGATCAGACCCAAACTGAAGCCAATCATCATACATGCCATTTGCCTGCAATACCGAGGAACTCGAAGGAAGTAACCATTTGTGATGAGATACTACATTATATTGACATGACAACAAAATAATGTTGAAATTATTTCCAACTATATTGCTATACATTAGATGTTTCCCATTCAATGATTGAAAATAGATATCAGACACAAATGATGTACAGGGATTTGCTAGTTTTATAATGTCCCAAGACTTGTTGTGGATACTAAAAAATCCATGCACGCCAAGTTATTCTTATAATAACTAATTTAATGCATTGTTCTG
   

Protein sequence:
>Potri.019G086200.1[834 residues] 
MKPQNLLFSLFLFFTVTTAQPTIQPGTTLSAANPGQTWSSPNNTFYVGFSQVDSSSYYTLTINYNGGVPIWTAGNATTTVDSKGSFQFLPSGNLRLLNGSGAVVWDSNTARLGVTTASLDDFGNLVLKNGTSTVWSSFDNPTDTIVPNQNFSVNQVLRSESYHFRFLSNGNLTLRWNDFILYWNQGLNSSLDVNLTSPTLGLQRTGVLTIFDVAFPSGSYTVASSNDYDEGGTRLRFLRLGKDGNFRMYSTAIGTGTITMVWSALTDQCEVFGYCGNMGICRYNESSSSPNCGCPSENFEPVDVNDSRQGCKRKVEIESCVGNATMLVLDNAKFLTYQPETLSQVFSNGISACRLNCLSQSSCIASTSLSDGTGMCYLKNSDFISGYQNPVLPSTSYVKVCGQAQPNPPPGLQIAEKSKSSSLRVWVVLVVVVITLLGLIAVEGGLWWWCCRNSPKFGSLSAQYALLEYASGAPVQFSYKELQRSTKQFKEKLGAGGFGAVYKGVLANRTVVAVKQLEGIEQGEKQFRMEVATISSTHHLNLVRLIGFCSEGRHRLLVYEFMKNGSLDNFLFTTEEQPGRLLNWEQRFNIALGTARGITYLHEECRDCIVHCDIKPENILLDENYNAKVSDFGLAKLISPRDHRYRTLTSVRGTRGYLAPEWLANLPITSKSDIYGYGMVLLEIVSGRRNFEVSAETDRKKFSAWAYEEFEKSNVTAILDQRLTDQDVDMQQVTRAIQVSFWCIQDQPSQRPKMGKVVQMLEGISEIENPPAPKAITEGSIPGTSILSSSNVSALSTFAPSAPTPSSSSSYQTLGVSPLASGRNIERASSSLLP
   



GO ID Description
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PFAM ID
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PANTHER ID
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KO ID
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EC ID
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KOG ID
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PlantGenIE GeneLists

Species Name Genes
Amborella trichopodascaffold00017.63; scaffold00017.67; scaffold00103.84; scaffold00068.90;
Oryza sativa ssp. japonicaOS03G62180;
Picea abiesMA_78595g0010; MA_5147g0010; MA_895977g0010; MA_7917g0010; MA_10426650g0010; MA_132342g0010; MA_91618g0010; MA_208216g0010; MA_10433041g0010; MA_202714g0010; MA_69585g0010; MA_126451g0020;
Pinus taedaPITA_000010770-RA; PITA_000057028-RA; PITA_000026418-RA; PITA_000039323-RA; PITA_000010766-RA; PITA_000070393-RA; PITA_000000064-RA; PITA_000092193-RA; PITA_000076221-RA; PITA_000038188-RA; PITA_000068370-RA; PITA_000035863-RA; PITA_000075905-RA; PITA_000002882-RA; PITA_000071608-RA; PITA_000010764-RA; PITA_000083463-RA; PITA_000062713-RA; PITA_000082318-RA; PITA_000086506-RA; PITA_000046598-RA; PITA_000077721-RA; PITA_000026666-RA; PITA_000051097-RA; PITA_000032910-RA; PITA_000083464-RA; PITA_000047189-RA; PITA_000086505-RA; PITA_000047190-RA; PITA_000082900-RA; PITA_000050875-RA; PITA_000026667-RA;
Populus trichocarpaPotri.013G115700; Potri.019G086200; Potri.019G086400; Potri.013G115800; Potri.019G086300; Potri.001G006100;
Selaginella moellendorffiiSM00070G01740; SM00002G02410;
Vitis viniferaVV18G16760;
Zea maysZM01G58990;


Methods of the gene family analysis can be found here.

No submitted publication available for this gene(Potri.019G086200).


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